A diferencia de la Fase 1, la Fase 2 retomará el tradicional formato de todos contra todos para definir al ganador del segundo torneo de la Liga 1 2021.
Un todos contra todos que permitirá ver el primer clásico del año entre Universitario y Alianza Lima, precisamente en la séptima fecha.
El ganador de la Fase 2 clasificará a los playoffs siempre y cuando acabe entre los 8 primeros de la tabla acumulada, caso contrario, perderá su derecho de admisión al cuadrangular por el título nacional.
¿Qué pasa si Sporting Cristal también gana la Fase 2? Dado su condición de ganador de la Fase 1, será declarado automáticamente campeón nacional.
El gerente de la Liga 1, Víctor Villavicencio, anunció que la Fase 2 acabará en octubre mientras que los playoffs se disputarán en noviembre. Todo ello debido a que la Liga 1 2022 empezará a más tardar en quincena de enero.