La Selección Argentina cayó en su visita a Paraguay, por las Eliminatorias Sudamericanas para el Mundial 2026, en lo que significó el primer triunfo de Gustavo Alfaro ante el seleccionado de su país.
Lionel Scaloni, el DT campeón del mundo en Qatar 2022 y bicampeón de América, se volvió a cruzar con Alfaro, ya que justamente las veces que el extécnico de Boca Juniors tuvo enfrente a la Selección Argentina fue con Scaloni como entrenador rival.
Después de cuatro enfrentamientos, al mando de Ecuador y Costa Rica, el Profe tuvo su primera victoria contra la Albiceleste, totalizando un triunfo, un empate y tres derrotas.
En el primer caso, con solo unas semanas en el cargo, la Tri perdió 1-0, merced al gol de Lionel Messi.
Después, en 2021, por la Copa América que Argentina ganó en Brasil, el equipo de Scaloni y el de Alfaro se enfrentaron en cuartos de final y fue triunfo por 3-0 de la Scaloneta, con goles de Rodrigo De Paul, Lautaro Martínez y Messi.
Ya en marzo de 2022, nuevamente por las Eliminatorias para la gran cita en Qatar, empataron 1-1 en Guayaquil. Fue el cierre de la clasificación rumbo al Mundial, con ambos conjuntos ya con la clasificación asegurada y Julián Álvarez metió el tanto de la Albiceleste.
"Con todo respeto, prefiero jugar con Argentina, Brasil, Uruguay, Inglaterra, a jugar contra otros equipos. Porque los que nos nivela para arriba es el nivel de los rivales que nosotros tengamos. Por más que la pasemos mal y no logremos un buen resultado. Eso es parte de la enseñanza. Al final del camino, queremos eso, ser competitivos", dijo Alfaro en marzo de 2024, previo al amistoso de Costa Rica ante Argentina.
El campeón mundial superó 3-1 a Los Ticos, en un amistoso en Los Ángeles, con goles de Ángel Di María, Alexis Mac Allister y Lautaro Martínez.
Y en noviembre del mismo año, ya como seleccionador de Paraguay, consiguió su primer éxito: tras el tanto inicial de Lautaro Martínez, la Albirroja remontó por intermedio de Antonio Sanabria y Omar Alderete.