Nacional acumula una mala racha jugando la fase final de la CONMEBOL Libertadores.
El Bolso lleva más de 10 años sin poder ganar un partido -desde octavos de final en adelante- de los cruces mano a mano por CONMEBOL Libertadores.
Después de sortear la fase de grupos y una serie de cruces en fase de clasificación (2014, 2015 y 2018), el último triunfo de Nacional en los denominados mata-mata de octavos de final en adelante data del 8 de mayo de 2013.
En aquella oportunidad los tricolores vencieron a Real Garcilaso 1 a 0 en el Estadio Centenario con gol de Gonzalo Bueno a los 57 minutos de juego. Debido a que Nacional había perdido 0-1 el partido de ida disputado en Cuzco, se recurrió a la definición por penales donde el Bolso quedó eliminado.
En la Copa de 2016 los tricolores igualaron los dos partidos en su cruce de octavos de final contra Corinthians de Brasil: 0 a 0 en el Parque Central y 2-2 en el Arena Corinthians de San Pablo, lo que permitió a Nacional clasificar por el valor del gol de visitante.
En cuartos de final se enfrentó con Boca Juniors. El partido de ida, jugado en el Parque Central, terminó 1-1. El mismo marcador se registró en La Bombonera por lo que se debió recurrir a la definición por penales donde ganó el equipo argentino.
En los octavos de final de la CONMEBOL Libertadores de 2017, Nacional perdió los dos partidos contra Botafogo de Brasil: 0-1 en el Parque y 0-2 en el estadio Olímpico Nilton Santos de Rio.
Otro tanto ocurrió en la edición de 2019, donde cayó en su cruce con Inter de Porto Alegre 0-1 en el Parque Central y 0-2 en el Beira-Rio.
En 2020, después de ganar el grupo F, se cruzó contra Independiente del Valle en octavos de final. Los dos partidos terminaron 0 a 0 y Nacional clasificó al ganar 4-2 por penales. En cuartos de final le tocó enfrentarse con River Plate de Argentina con el que perdió 2-0 en cancha de Independiente y fue goleado 6-2 en el Parque Central.
En los octavos de final de 2023 y 2024 quedó afuera ante Boca Juniors y San Pablo, respectivamente, sin poder ganar un partido en los 90 minutos.
La racha de Nacional
Libertadores 2016
Octavos de final
Nacional 0 – Corinthians 0
Corinthians 2 – Nacional 2
Cuartos de final
Nacional 1 – Boca Juniors 1
Boca Juniors 1 – Nacional 1
Libertadores 2017
Botafogo 1 – Nacional 0
Nacional 0 – Botafogo 2
Libertadores 2019
Nacional 0 - Inter de Porto Alegre 1
Inter de Porto Alegre 2 – Nacional 0
Libertadores 2020
Octavos de final
Independiente del Valle 0 – Nacional 0
Nacional 0 – Independiente del Valle 0
Cuartos de final
River Plate 2 – Nacional 0
Nacional 2 – River Plate 6
Libertadores 2023
Nacional 0 – Boca Juniors 0
Boca Juniors 2 - Nacional 2
Libertadores 2024
Nacional 0 - San Pablo 0
San Pablo 2 - Nacional 0