Desde Argentina afirman que Independiente acudió ante la FIFA para contrademandar a Fernando Gaibor y Guayaquil City por la cifra de 20 millones de dólares.
Desde el club de Avellaneda alegan que se ha cumplido todas las obligaciones al jugador y en consecuencia, que su habilitación provisional como la firma de contrato con Guayaquil City es ilegítima porque el pase les pertenece a ellos.
El elenco de Avellaneda fue en su momento increpado por el mediocampista que logró que le otorguen una habilitación provisional. Varios clubes del medio local lo pretendían, como Liga y Barcelona SC, pero evitaron su contratación por los temas legales que no terminaban de quedar claros y ahora el tiempo parece que les da la razón.
En su momento el jugador había destacado que su llegada al City fue porque con ellos había alcanzado un acuerdo económico satisfactorio: "El City hizo un esfuerzo y me sedujo mucho el proyecto deportivo que hay, es muy bueno, estamos peleando sudamericana y seguramente voy a cumplir mis objetivos".