Barcelona quedó eliminado de la Copa Ecuador ante Independiente Juniors y sumó una nueva frustración en este torneo, que desde su retorno ha sido esquivo para el máximo campeón ecuatoriano.
En los dieciseisavos de final quedó fuera ante Independiente Juniors, equipo de Serie B y filial de los Rayados. En su cancha ganaron por 2-0 ante prácticamente el equipo estelar de los amarillos y se instalaron en octavos de final.
En el torneo de 2019 fue cuando más lejos pudieron llegar. Se instalaron en las semifinales, en una eliminación increíble en manos de Delfín. En la ida, Barcelona ganó por 4-1, pero en la vuelta Delfín igualó la serie al ganar 3-0; en ese torneo se definió al vencedor por el gol de visita.
Mientras que en la edición anterior, en 2022, tampoco pudo pasar de los dieciseisavos de final. Ahí ya se modificó el reglamento y solo se jugaría un partido, por lo que en esa ronda cayó por 2-1 ante El Nacional, en ese entonces equipo de la Serie B.